距今超过六千年的远古世界，天地割裂的凄惨战争持续不断，毫无还手之力的人类被拥有强大力量的各个种族逼入绝境，濒临灭亡。此时率领人类的年轻领袖里克，与机凯种少女休比偶然相遇。被同伴抛弃的休比，为了修复

　　活泼的运动女孩日向咲，和喜爱美术的少女美翔舞，她们是就读夕凪中学的平凡中学生。为了阻止想用毁灭之力支配世界的邪恶大王，咲和舞借助泉之乡的精灵－弗拉比和乔比之力变身成传说中的战士“光之美少女”，努力